În timp ce Madagascar este cunoscută pentru animalele sale ciudate şi pădurile frumoase, o mare parte a ţării a suferit prejudicii severe asupra mediului. Multe păduri de pe insulă au fost tăiate, în timp ce solul fertil de valoare importantă pentru culturile de semănat dispar din cauza eroziunilor. Deoarece Madagascar este printre ţările cele mai sărace ale lumii, supraviețuirea de zi-de-zi a oamenilor depinde de utilizarea resurselor naturale. Cei mai mulți dintre malagași niciodată nu au posibilitatea de a deveni un doctor, programator, lucrător de fabrică, sau secretar; aceștia trebuie să trăiască din terenul care îi înconjoară, utilizând orice resurse ce pot găsi. Sărăcia lor coastă țara şi toată lumea, prin pierderea biodiversităţii endemice ale insulei.
Probleme majore de mediu din Madagascar includ:
Despăduriri şi distrugerea habitatelor
Incendii agricole
Eroziuni şi degradări ale solului
Exploatarea in exces a resurselor vii, inclusiv vânătoarea şi colecţia în exces de specii din sălbăticie